В студенческие годы Николай Дроздов женился на девушке по имени Инна. У супругов родилась дочь, однако брак продлился недолго. Вскоре жена ушла от Дроздова. Неоднократно он пытался помириться с ней, но безуспешно. После этих отношений популярный ученый был одинок 20 лет. Сохранить добрые отношения с экс-супругой и дочерью у Николая Николаевича не получилось.
"Я хотел продолжать отношения, но супруга выступила против. Не я от нее ушел, а она от меня. Это вам сейчас кажется, что я хороший человек, но по молодости было по-иному. Уже в том возрасте я любил путешествовать, может, ей это не нравилось. Мы разошлись без конфликтов. Дочку по неделям брали к себе. Сказали ей, чтобы не жаловалась на маму и папу. И с Инной, и с дочкой Надей у меня остались товарищеские отношения, но их нельзя назвать дружескими. Дочь сейчас занимается экологическим туризмом", - рассказал биолог.
Сейчас Дроздов уже 40 лет состоит в браке с супругой Татьяной, которая также родила ему дочь Елену. Со второй женой ученый познакомился в лифте собственного подъезда, выяснилось, что они жили в одном доме. Младшая дочь телеведущего занимается ветеринарией.